En général, il est conseillé de conserver les menus d’Reader afin que vous puissiez les utiliser pendant vos manipulations. Il est possible de les masquer à l'aide de la commande Affichage > Barre des menus. Cependant, la seule manière de les afficher et de les utiliser de nouveau consiste à appuyer sur la touche F9 (Windows) ou Maj+Commande+M (Mac OS).
Reader dispose également de nombreux menus contextuels. Pour y accéder, vous cliquez avec le bouton droit de la souris/en maintenant la touche Contrôle enfoncée sur un élément de la zone de travail ou du document PDF auquel est associé un tel menu. Un menu contextuel affiche les commandes relatives à l'élément ou à la zone activé(e). Par exemple, lorsque vous cliquez sur la zone des barres d'outils avec le bouton droit de la souris/en maintenant la touche Contrôle enfoncée, le menu contextuel correspondant affiche les mêmes commandes que le menu Affichage > Barres d'outils.